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        <dc:description xml:lang="en">&lt;html&gt;&lt;body&gt;&lt;title&gt;AT4G01830.1&lt;/title&gt;(&amp;uarr; Click "Links", if this line appears at the beginning.)&lt;br&gt;&lt;H1&gt;Other supporting information&lt;/H1&gt;&lt;table&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan="2" align="left"&gt;&lt;b&gt;Gene Model&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP width="75"&gt;&lt;/td&gt;&lt;td NOWRAP&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u420183001000i/AT4G01830.1.gene_models.png" width="717"&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td colspan=2 align="left"&gt;&lt;b&gt;Correlation Plot&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td NOWRAP colspan="2" align="left"&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u420183001000i/AT4G01830.1.CorrPlot.jpg" width="800"&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Expression profile (Values are plotted in Log(2) values.)&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;img src="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u420183001000i/AT4G01830.1.F0.Expression.png"&gt;&lt;br&gt;&lt;hr&gt;&lt;b&gt;Genes with related expresssion profiles.&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;table border=1&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Positively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u123672001000i"&gt;AT1G36720.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.928592&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u420391201000i"&gt;AT4G03912.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.89312&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u125560001000i"&gt;AT1G55600.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.892812&lt;/td&gt;&lt;td&gt;WRKY10 (WRKY DNA-BINDING PROTEIN 10)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u320975001000i"&gt;AT3G09750.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.85409&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u123409701000i"&gt;AT1G34097.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.845117&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u523968001000i"&gt;AT5G39680.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.843198&lt;/td&gt;&lt;td&gt;EMB2744 (EMBRYO DEFECTIVE 2744)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u524380001000i"&gt;AT5G43800.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.838213&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u523728001000i"&gt;AT5G37280.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.830974&lt;/td&gt;&lt;td&gt;zinc finger (C3HC4-type RING finger) family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u420019001000i"&gt;AT4G00190.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.830176&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pectinesterase family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u323192001000i"&gt;AT3G31920.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0.825941&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable element gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th colspan=7 align="left"&gt;Negatively Correlated Genes&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Gens&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PCC&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Overlap gene(antisense)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Definition&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u526424002000i"&gt;AT5G64240.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.836916&lt;/td&gt;&lt;td&gt;AtMC3 (metacaspase 3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P019730&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u526036003000i"&gt;AT5G60360.3&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.796441&lt;/td&gt;&lt;td&gt;AALP (Arabidopsis aleurain-like protease)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P018380&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT5P116140&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u123412002000i"&gt;AT1G34120.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.793907&lt;/td&gt;&lt;td&gt;IP5PI (INOSITOL POLYPHOSPHATE 5-PHOSPHATASE I)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u423464001000i"&gt;AT4G34640.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.789761&lt;/td&gt;&lt;td&gt;SQS1 (SQUALENE SYNTHASE 1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT4P011870&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u120217001000i"&gt;AT1G02170.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.787968&lt;/td&gt;&lt;td&gt;AMC1 (METACASPASE 1)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P000500&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u221557002000i"&gt;AT2G15570.2&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.783918&lt;/td&gt;&lt;td&gt;thioredoxin M-type 3, chloroplast (TRX-M3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT2P101810&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u422026004000i"&gt;AT4G20260.4&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.777306&lt;/td&gt;&lt;td&gt;DREPP plasma membrane polypeptide family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT4P006170&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u124479001000i"&gt;AT1G44790.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.770566&lt;/td&gt;&lt;td&gt;ChaC-like family protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT1P111290&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u222375501000i"&gt;AT2G23755.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.763604&lt;/td&gt;&lt;td&gt;unknown protein&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;OMAT2P004790&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s2ria00227u221392001000i"&gt;AT2G13920.1&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-0.761739&lt;/td&gt;&lt;td&gt;pseudogene, CHP-rich zinc finger protein, putative, contains weak PHD zinc finger motifscontains weak PHD zinc finger motifsDC1 domain, a divergent protein kinase C domain of unknown function.&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;a href="/dbfiles/SciNetS_ria227i/cria227s2i/cria227s2ria227u420183001000i/AT4G01830.1-correlation.txt"&gt;Get whole results&lt;/a&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt; &lt;HR&gt;&lt;b&gt;Over-Representation Analysis Result&lt;/b&gt;&lt;br&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr bgcolor=#FF69B4&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;:20 terms with high significance&lt;/td&gt;&lt;/a&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFACD&gt;&lt;td&gt;1.00e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 8.76e-06&lt;/td&gt;&lt;td&gt;                  :With considering multiple testing correction;&lt;br&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt; &lt;=  1.00e-02 / 1142&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;8.76e-06 &lt; &lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value&lt;/td&gt;&lt;td&gt; &lt;= 1.00e-02&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;br&gt;&lt;table border="1"&gt;&lt;tr&gt;&lt;th&gt;Type of term (*1)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Depth of the term in ontology tree&lt;/th&gt;&lt;th&gt;ID/Term&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Description&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Number of genes&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Over-Representative rate (*2)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;&lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*3)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;PosMed &lt;i&gt;p&lt;/i&gt;-value (*4)&lt;br&gt; (Link to PosMed)&lt;/th&gt;&lt;th&gt;Found on gene annotation&lt;/th&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;B&lt;/td&gt;&lt;td&gt;5&lt;/td&gt;&lt;td&gt;GO:0006396&lt;/td&gt;&lt;td&gt;RNA processing&lt;/td&gt;&lt;td&gt;10/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;4.52&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.58e-05&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed/search?actionType=searchexec&amp;objectSet=gene&amp;species=At&amp;condition=GeneIds&amp;associationDirectMode=2&amp;associationRelationMode=2&amp;geneIds1=AT4G01830&amp;keyword=processing"&gt;3.00E-94&lt;/a&gt;&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;B&lt;/td&gt;&lt;td&gt;5&lt;/td&gt;&lt;td&gt;GO:0016070&lt;/td&gt;&lt;td&gt;RNA metabolic process&lt;/td&gt;&lt;td&gt;19/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.23&lt;/td&gt;&lt;td&gt;3.66e-04&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;B&lt;/td&gt;&lt;td&gt;5&lt;/td&gt;&lt;td&gt;GO:0090304&lt;/td&gt;&lt;td&gt;nucleic acid metabolic process&lt;/td&gt;&lt;td&gt;25/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.66&lt;/td&gt;&lt;td&gt;4.44e-03&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor="#555555" height="10"&gt;&lt;td colspan="9"&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;C&lt;/td&gt;&lt;td&gt;5&lt;/td&gt;&lt;td&gt;GO:0005634&lt;/td&gt;&lt;td&gt;nucleus&lt;/td&gt;&lt;td&gt;30/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.92&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.95e-04&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;C&lt;/td&gt;&lt;td&gt;4&lt;/td&gt;&lt;td&gt;GO:0044428&lt;/td&gt;&lt;td&gt;nuclear part&lt;/td&gt;&lt;td&gt;10/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;3.01&lt;/td&gt;&lt;td&gt;5.63e-04&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor="#555555" height="10"&gt;&lt;td colspan="9"&gt;&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;value&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;35/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;2.08&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.05e-05&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr bgcolor=#FFFFFF&gt;&lt;td&gt;KW&lt;/td&gt;&lt;td&gt;0&lt;/td&gt;&lt;td&gt;transposable_element_gene&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;44/200&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.88&lt;/td&gt;&lt;td&gt;1.20e-05&lt;/td&gt;&lt;td&gt;-&lt;/td&gt;&lt;td&gt;no&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr 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description.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*2)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;([# of genes with the term] / [# of sampling (200)]) / ([# of genes with the term among whole genes] / [# of whole genes])          &lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*3)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;P-values were calculated on hypergeometric distribution in which we found &lt;i&gt;n&lt;/i&gt; genes with a annotation term during 200           highly correlated genes, while we had &lt;i&gt;N&lt;/i&gt; genes           with the term in the whole genes.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;tr&gt;&lt;td valign=top&gt;(*4)&lt;/td&gt;&lt;td&gt;&lt;a href="http://omicspace.riken.jp/PosMed-plus/"&gt;PosMed&lt;/a&gt; is a system which serve a p-values showing a relationship           between the gene and the annotation term based on literature information and Gene-Gene interaction suchas co-expression or           protein-protein interactions.&lt;/td&gt;&lt;/tr&gt;&lt;/table&gt;&lt;hr&gt;&lt;a href="/db/SciNetS_ria227i/cria227s904i"&gt;Top Page&lt;/a&gt;&lt;/body&gt;&lt;/html&gt;</dc:description>
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